长航凤凰重庆货运公司按照集团和长航凤凰“十一五”期节能减排工作总体部署，把握建设长江上游航运中心的新机遇，依靠“科技创新、科学发展、强化管理”的方针，盯紧“单位能耗下降20%”的总目标，狠抓节能减排工作。截止2010年11月底，该司在川江年均货运量持续增量的前提下，实现企业燃油综合单耗2.68千克/千吨千米，较“十五”期末企业综合单耗4.4千克/千吨千米下降40%，减少二氧化碳排放量8000余吨，超额实现“十一五”期节能减排目标。
    节能减排事关水运行业生存发展。“十一五”期间，该司把节能减排作为增强企业市场竞争力的有效方法来抓，成立了以公司党政领导任组长，机务、安全生产分管领导任副组长，船舶技术部、安全生产部为组员的领导及攻关组，先后在50多个船舶基层单位成立现场节能减排管理小组，总经理与基层单位及管理部门签订节能减排责任状，明确各级责任，把新船建造转型、能源管理、能源激励、科技节能等目标细化到每一个单位，有效实施月度、季度、年度考核机制。
    “十一五”期以来，随着川江航道不断改善，该司着力发展新船型、新机型、低能耗的川江运输货轮，目前拥有5000吨至2000吨级货轮共32艘，新增运力2.6万千瓦，淘汰老旧大马力拖轮3.5万千瓦、驳船120艘。新型运力承担了公司三分之二的运输生产任务，部分船舶平均单耗低至2.15公斤/千吨千米，大大降低了企业综合燃油单耗，为公司节能减排奠定了良好基础。同时，不断加强用能设备的维修保养以及技改更新工作，确保设备使用性能，为节能减排提供技术支撑。
    “十一五”期间，该司在重点发展、优化运力的基础上，进一步强化节能管理，以“低能耗高产出”为基础提升企业效益。该司在节能减排工作中坚持管用一体的模式，充分发挥管理部门的模范带头作用，先后制定并实施了《船舶燃油节能管理办法》、《船舶燃油统计管理办法》及《船舶燃油对标管理办法》，将船舶燃油管理细化到每一个航次，对港作、停泊、转闸、助拖等油耗分明别类进行统计管理，船舶停靠尽可能用岸电或应急电瓶供电，航行中重点落实各项节能减排措施，并推行航次燃油包干制度，把节约燃油的10%用来奖励船舶，通过激励机制彻底改变了职工的节能观念，由“要我节能”变成了“我要节能”，有效提高了全员参与节能减排工作积极性。
    该司同时注重科技节能在节能减排中的重要作用，在每艘机动船舶安装了生活污水处理装置，杜绝未处理的污水排放入江。在每艘船舶安装润滑油分离机，使船舶润滑油得到循环利用。对使用0#柴油主机的货轮进行劣质油技术改造，并在公司11艘货轮中进行了全面推广，节约燃油成本达16%。在使用劣质油的船舶中，推广使用燃油添加剂，从而减少了船舶停航检修时间，提高船舶营运率2%。在每艘机动船舶安装“3G”系统，使公司所有船舶实现联网运行，一方面船舶时时准确掌握航行速度，另一方面实现船舶与公司管理部门的基础数据传输，便于公司管理部门及时掌握船舶的节能减排情况。
    目前，长航凤凰重庆货运公司在超额完成“十一五”期节能减排任务的基础上，进一步强化工程类节能减排技术的研究，有针对性地突破节能减排项目，已涉及船舶“油改气”等重大科研项目，并取得一定进展，节能减排工作有望再上新台阶。