10月1日，巴拿马运河管理局宣布，为在短期内降低运河通行费和加大其预定航道通行的收费灵活性，该局将延长6月1日开始实施的通行费折扣计划至2010年4月底。

6月1日开始实施的通行费折扣计划是为了帮助使用巴拿马运河的航运公司渡过经济危机的影响制定的临时措施，是同用户磋商的结果，实施时间从6月1日开始持，续时间四个月，到9月30日为止。

巴拿马运河管理局称，该局是应其用户和国际航运协会圆桌会议的要求延长折扣计划的。巴拿马运河管理局总裁阿尔韦托阿莱曼苏维塔指出，巴拿马运河管理局承诺在经济不稳定时期同用户保持公开对话。因为巴拿马运河的用户认为临时降低运河通行费措施有价值，所以延长实施时间。

临时措施的两大亮点是：

为满载通过巴拿马运河的集装箱船（不搭载旅客和货物的船舶）重新定义压载物和修订预定系统增加灵活性和减少运河通行费用。

    修改运河通行预定系统，增加船舶通过运河时间安排上的灵活性和降低通行费。

临时重新定义的全集装箱船压舱集装箱通过运河的收费办法，使运输的集装箱低于或等于运力30%的集装箱船的压舱集装箱的通行费下降到了57.60美元/标箱（20英尺集装箱），比满载货物集装箱船的通行费72美元/标箱，将少了14.40美元/标箱。

继续执行所有采用预定系统预约通过巴拿马运河的船舶的基本预定价格下调政策。

举例来说，一艘宽度大于或等于100英尺，长度大于等于900英尺的巨型船舶，每通过运河一次的基本预定价仍将在去年五月份生效的通行费的基础上减少5,000美元。

对于没有按照预定计划到达通过运河的船舶可以选择降低通行费保留预定并在同一天通过运河。这项临时措施为航运公司提供了通过运河的灵活性。不过降低通行费多少取决于船舶到达运河的时间。

此外，运河的用户还可以在预定的船舶正式通过运河日期前30天，在不增加费用的情况下，申请更改通过运河时间。此前，用户则要在预定的船舶正式通过运河日期前60天，在不增加费用的情况下，要求更改通过运河的时间。这项临时措施给航运公司提供了更加灵活的更改通过运河的时间，使用户可以用另一艘相同尺寸的船舶来替换预定通过运河的船舶。