马耳他交通部统计数据显示，截至2014年底，在马耳他注册商船2500艘，吨位数5790万。2014当年注册吨位同比增长12.5%，马耳他成为世界第六大商船注册地，这对于马耳他是一个里程碑，作为欧洲最大的船旗国，马进一步巩固了其地中海海事中心的地位。

此外，马在商业游艇注册方面也居于世界领先地位，截至2014年年底，悬挂马国旗超过24米长的超级游艇452艘。